More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2091 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  73.22 
 
 		 296 aa  447  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  73.81 
 
 		 299 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  61.02 
 
 		 296 aa  351  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  55.41 
 
 		 296 aa  348  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  50.51 
 
 		 295 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  52.9 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  49.83 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 		 295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  52.9 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  53.24 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  50.34 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  50.34 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  48.29 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  52.56 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  60.96 
 
 		 310 aa  301  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  52.56 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  50 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  45.24 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  49.15 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  52.22 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  48.21 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  47.23 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  47.23 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  47.88 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  45.78 
 
 		 331 aa  278  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  48.24 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  46.25 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  46.25 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  48.78 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  46.91 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  45.61 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  47.96 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  49.13 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  46.5 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  49.21 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  47.2 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  45.8 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  45.02 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  38.33 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  38.59 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  51.08 
 
 		 145 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  37.66 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  38.17 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  39.65 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  37.05 
 
 		 227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  36.19 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  32.65 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  41.88 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  41.88 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  34.35 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  34.35 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  34.35 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  33.97 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  34.06 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  34.06 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  36.56 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  34.06 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 		 409 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  34.5 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.92 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  34.5 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  34.5 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  34.5 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  30.65 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  37.05 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  31.43 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  31.43 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  31.43 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  31.43 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  31.43 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  33.48 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  34.78 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>