More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0735 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  64.38 
 
 		 294 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  60.41 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  61.43 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  61.43 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  59.73 
 
 		 295 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  60.75 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  61.43 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  60.41 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  61.09 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  62.12 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  56.21 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  63.39 
 
 		 254 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  55.41 
 
 		 303 aa  348  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  54.17 
 
 		 295 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  53.95 
 
 		 297 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  60.41 
 
 		 295 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  52.36 
 
 		 295 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  54.95 
 
 		 296 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  55.14 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  56.66 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  48.47 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  50.53 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  49.83 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  50.53 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  49.83 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  49.5 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  50.17 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  49.83 
 
 		 320 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  46.82 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  49.16 
 
 		 320 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  48.48 
 
 		 326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  47.81 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  47.81 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  48.48 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  50.84 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  46.48 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 		 291 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  41.9 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  42.76 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  65.44 
 
 		 136 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  40.08 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  55.47 
 
 		 145 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  61.21 
 
 		 116 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  37.26 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.73 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  39.41 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  42.86 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  33.45 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  33.45 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  33.45 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  38.24 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.68 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 		 227 aa  109  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.8 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.73 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.8 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  37.07 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.44 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  35.94 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  30.77 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.15 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  34.16 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  35.75 
 
 		 214 aa  97.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  35.5 
 
 		 228 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.02 
 
 		 230 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.02 
 
 		 230 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 230 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  31.8 
 
 		 232 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  33.78 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 		 228 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  35.75 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  35.75 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  32.57 
 
 		 223 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>