More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3311 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  80.5 
 
 
318 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  72.04 
 
 
303 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  72.04 
 
 
303 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  71.38 
 
 
322 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  38.51 
 
 
324 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  42.31 
 
 
313 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  36 
 
 
295 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  35.33 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  34.56 
 
 
295 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  33.89 
 
 
295 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  35.47 
 
 
295 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  40.09 
 
 
291 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  35.47 
 
 
295 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  34.46 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  34.8 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  35.45 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  32.09 
 
 
297 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
295 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  37.45 
 
 
254 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  36.49 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  35.45 
 
 
295 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 
295 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  33.55 
 
 
295 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 
303 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 
295 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  37.71 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 
295 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  30.87 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  31.65 
 
 
305 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  31.31 
 
 
305 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
320 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  29.67 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  32.44 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
326 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 
320 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  33.11 
 
 
326 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  31.54 
 
 
320 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  38.94 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  31.79 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  38.46 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 
293 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  32.45 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  39.5 
 
 
276 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
250 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.93 
 
 
261 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
292 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  37.61 
 
 
228 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  35.48 
 
 
278 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.66 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
307 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.76 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  33.03 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  34.38 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.9 
 
 
257 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  31.32 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  31.32 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  31.32 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  31.32 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  34.73 
 
 
239 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  32.68 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.57 
 
 
271 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.41 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  37.13 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.41 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.41 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  35.35 
 
 
227 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  32.04 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.11 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.11 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 
238 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  32.41 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  33.02 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  33.02 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  30.62 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  36.22 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  31.94 
 
 
290 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 
291 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  37.81 
 
 
243 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  31.94 
 
 
290 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  32.55 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  41.86 
 
 
136 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  35.54 
 
 
244 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  28.31 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 
246 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  33.01 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>