More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1304 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  96.43 
 
 		 224 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  90.58 
 
 		 224 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  84.82 
 
 		 246 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  77.68 
 
 		 224 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  52.02 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  49.14 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  47.83 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  46.52 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  46.09 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  46.09 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  44.78 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  44.78 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  43.48 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  41.56 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  42.61 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  44.35 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  41.48 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  39.91 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  39.04 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  37.67 
 
 		 292 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  37.21 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.03 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 290 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  35.84 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  36.06 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  31.11 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 291 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  32.33 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  31.28 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 		 407 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  35.53 
 
 		 295 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  36.74 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 		 407 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  35.09 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  37.26 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  35.09 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  34.65 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 		 297 aa  98.2  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  31.52 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  31.06 
 
 		 409 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  31.3 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 296 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  36.91 
 
 		 305 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 433 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 		 296 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 		 275 aa  92  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 		 303 aa  91.7  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  33.33 
 
 		 410 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  36.24 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  34.45 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 		 307 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  32.48 
 
 		 287 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  28.03 
 
 		 262 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  27.41 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.84 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 409 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  32.04 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  27.62 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  35.96 
 
 		 320 aa  85.1  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 		 291 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  28.39 
 
 		 263 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 		 291 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>