More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6683 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  99.16 
 
 
237 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  99.16 
 
 
237 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  94.07 
 
 
237 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  90.3 
 
 
237 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  90.25 
 
 
237 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  89.41 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  75.53 
 
 
238 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  75.53 
 
 
238 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  75.21 
 
 
235 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  74.26 
 
 
238 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  74.26 
 
 
238 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  75.42 
 
 
236 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  72.65 
 
 
235 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  74.56 
 
 
230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  64.63 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  55.75 
 
 
227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  46.75 
 
 
228 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 
224 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  44.35 
 
 
224 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  44.35 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 
224 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  43.1 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  37.97 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  37.83 
 
 
243 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  38.91 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
231 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.44 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
290 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
290 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 
254 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.33 
 
 
251 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
214 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
291 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  28.84 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  35.27 
 
 
296 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.22 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
296 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
292 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.59 
 
 
232 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 
407 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
407 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  31.38 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
295 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.73 
 
 
261 aa  91.7  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.65 
 
 
295 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  32.44 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  31.38 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.82 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.63 
 
 
295 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 
307 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  31.5 
 
 
292 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  31.22 
 
 
295 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  31.22 
 
 
295 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  29.49 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 
230 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 
230 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  30.8 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  32.19 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  29.75 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  32.21 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  30.99 
 
 
413 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  30.38 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  33.15 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.82 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 
246 aa  82  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.38 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  31.33 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  31.31 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  31.45 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  32.17 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>