More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5840 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  99.16 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  93.64 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  89.87 
 
 		 237 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  88.98 
 
 		 237 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  89.83 
 
 		 237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  75.11 
 
 		 238 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  74.79 
 
 		 235 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  75.11 
 
 		 238 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  73.84 
 
 		 238 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  73.84 
 
 		 238 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  75 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  72.22 
 
 		 235 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  74.12 
 
 		 230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  64.19 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  55.31 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  46.32 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  44.78 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  43.91 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  43.91 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  42.61 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  42.67 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  37.55 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  38.46 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  35.8 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.02 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.33 
 
 		 251 aa  104  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 		 263 aa  99  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 		 296 aa  98.2  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 		 296 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 		 407 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 407 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  30.96 
 
 		 262 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.59 
 
 		 295 aa  91.7  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.22 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.36 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  30.96 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.82 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 		 307 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  29.49 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 299 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  31 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  30.8 
 
 		 295 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  30.8 
 
 		 295 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  30.38 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  29.48 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  28.98 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  31.4 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  32.21 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  31.76 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.6 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  28.09 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  27.98 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.88 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  33.15 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  31.54 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  29.96 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.29 
 
 		 413 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30.46 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  31.31 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  31.45 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  29.57 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  25.98 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>