More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0841 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0898  dienelactone hydrolase  85.53 
 
 
228 aa  360  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0905953  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  37.72 
 
 
227 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  39.3 
 
 
227 aa  149  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  39.83 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  38.12 
 
 
241 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
214 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  35.06 
 
 
291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  34.48 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  34.33 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  34.65 
 
 
291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 
224 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 
230 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 
295 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 
293 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
234 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
238 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
238 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
296 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 
235 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  34.09 
 
 
296 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 
235 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  34.5 
 
 
303 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
238 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
238 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
236 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  36.16 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
227 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  36.16 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.53 
 
 
230 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.19 
 
 
299 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.76 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.47 
 
 
295 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  36.64 
 
 
410 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
297 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  29.87 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
261 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  32.51 
 
 
295 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  28.27 
 
 
295 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 
237 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 
296 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 
237 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  30.3 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  30.3 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  29.87 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
433 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
296 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
298 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  29.87 
 
 
295 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  29.66 
 
 
409 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 
300 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 
407 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  30.45 
 
 
413 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  29.54 
 
 
295 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.09 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 
420 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 
407 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.38 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.87 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.57 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.17 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.95 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.11 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  28.11 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 
408 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 
255 aa  79  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  29.52 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  28.51 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
291 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  25.52 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  30.73 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  27.62 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  32.12 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  27.76 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>