More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3321 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  92.14 
 
 		 433 aa  785    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  73.96 
 
 		 415 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 409 aa  847    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  75.37 
 
 		 415 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  75.37 
 
 		 409 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  75.62 
 
 		 415 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  75.12 
 
 		 409 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  75.37 
 
 		 415 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  72.32 
 
 		 411 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  68.87 
 
 		 420 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  65.21 
 
 		 413 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  66.26 
 
 		 410 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  64.96 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  61.71 
 
 		 407 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  61.35 
 
 		 407 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  58.48 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  74.72 
 
 		 181 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  57.81 
 
 		 236 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  50.86 
 
 		 231 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  45.34 
 
 		 412 aa  222  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  56.89 
 
 		 193 aa  212  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  47.03 
 
 		 235 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  55.63 
 
 		 178 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  42.04 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  54.3 
 
 		 179 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  45.93 
 
 		 233 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  42.47 
 
 		 232 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  42.13 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 		 230 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  41.36 
 
 		 232 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  41.85 
 
 		 230 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  41.85 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  41.85 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  42.74 
 
 		 232 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  41.85 
 
 		 230 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  42.01 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  42.34 
 
 		 236 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 		 230 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  41.05 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  41.44 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  41.59 
 
 		 232 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  43.61 
 
 		 230 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  41.44 
 
 		 237 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  40.53 
 
 		 230 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  41.85 
 
 		 230 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  41 
 
 		 234 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  39.39 
 
 		 222 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  35.56 
 
 		 236 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.3 
 
 		 234 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  42.05 
 
 		 235 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  38.57 
 
 		 248 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  41.5 
 
 		 234 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  55.17 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 		 240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  36.12 
 
 		 221 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 		 223 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  34.47 
 
 		 229 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  35.24 
 
 		 223 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 		 229 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  35.5 
 
 		 220 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  31.05 
 
 		 252 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 		 229 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 230 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 227 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.94 
 
 		 295 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.94 
 
 		 295 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  33.49 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.94 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 		 230 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.29 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  32.17 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 		 246 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  31.96 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  34.18 
 
 		 223 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  30.81 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  34.12 
 
 		 248 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30.81 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  36.45 
 
 		 191 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 		 251 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.11 
 
 		 296 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  33.89 
 
 		 227 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 243 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 		 235 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 		 224 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 		 230 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 303 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 		 228 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>