More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2600 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  39.57 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  38.26 
 
 		 291 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  44.33 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  37.19 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  37.5 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  36.7 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  36.7 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  36.24 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  36.24 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  39.25 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  41.76 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  34.84 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  41.53 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  41.53 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  38.24 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  38.89 
 
 		 295 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  36.09 
 
 		 295 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  36.89 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  39.7 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  38.94 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  33.86 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.26 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  36.45 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  32.57 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  36.59 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  35.41 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  33.98 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.98 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  33.98 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  34.3 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  33.98 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  36.16 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  33.18 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 		 326 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  31.53 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  35.23 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  32.21 
 
 		 326 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  37.19 
 
 		 408 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 227 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.62 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  32.21 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 300 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  31.73 
 
 		 326 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  33.64 
 
 		 305 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 291 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 		 236 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  33 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  31.16 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  31.07 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  31.16 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  33 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 		 294 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  31.54 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.52 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  32.51 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  32.51 
 
 		 320 aa  92.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  31.69 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  29.18 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  29.18 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  28.03 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.41 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  29.06 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.14 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  29.18 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  34.68 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>