More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1006 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 		 320 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  90.25 
 
 		 320 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  89.62 
 
 		 320 aa  590  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  89.94 
 
 		 320 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  85.67 
 
 		 326 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  85.35 
 
 		 326 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  84.08 
 
 		 326 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  84.39 
 
 		 326 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  83.33 
 
 		 331 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  69.51 
 
 		 305 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  69.18 
 
 		 305 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  64.14 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  63.43 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  53.21 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  53.21 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  52.88 
 
 		 295 aa  321  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  50.8 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  51.77 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  49.84 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  48.06 
 
 		 295 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  48.2 
 
 		 298 aa  298  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  48.85 
 
 		 295 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  49.68 
 
 		 295 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  50 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  49.83 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  49.68 
 
 		 295 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  51.33 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  55 
 
 		 254 aa  288  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  49.03 
 
 		 295 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  47.21 
 
 		 296 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  48.24 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  45.16 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  45.82 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  47.83 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  47.16 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  49.01 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  40.59 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  39.05 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  39.17 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  37.97 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  54.07 
 
 		 136 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  50.64 
 
 		 145 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  57.5 
 
 		 116 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  36.34 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  35.89 
 
 		 227 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  31.54 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  36.32 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 		 232 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.44 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  34.63 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 		 278 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  33.49 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 230 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  35 
 
 		 276 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 		 251 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 420 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  33.81 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.69 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.17 
 
 		 236 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 		 223 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 235 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 230 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 		 236 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 248 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 		 275 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  35.92 
 
 		 224 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  32.51 
 
 		 264 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  36.14 
 
 		 222 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  30.29 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.18 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.3 
 
 		 223 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 		 224 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 		 214 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>