More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6385 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  66.96 
 
 
236 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  65.94 
 
 
238 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  65.94 
 
 
238 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  63.91 
 
 
235 aa  321  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  66.38 
 
 
238 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  66.38 
 
 
238 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  67.69 
 
 
230 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  63.48 
 
 
235 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  64.78 
 
 
237 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  64.19 
 
 
237 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  63.32 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  64.19 
 
 
237 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  64.63 
 
 
237 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  64.19 
 
 
237 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  63.48 
 
 
237 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  53.54 
 
 
227 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  43.72 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  45.41 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
224 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  43.72 
 
 
246 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  41.56 
 
 
224 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  41.56 
 
 
224 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  40.43 
 
 
227 aa  148  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  38.98 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  38.96 
 
 
243 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  36.36 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  36.25 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  36.61 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 
295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  36.02 
 
 
296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  35.75 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 
231 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  35.95 
 
 
295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  36.75 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  36.78 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.4 
 
 
251 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.06 
 
 
295 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.06 
 
 
295 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  32.64 
 
 
254 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
295 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 
299 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
295 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  34.3 
 
 
291 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
295 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
290 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
295 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
290 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.23 
 
 
254 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
292 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  34.73 
 
 
293 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  32.99 
 
 
292 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
307 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  36.41 
 
 
297 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
320 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
229 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
229 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
433 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  32.54 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 
296 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
295 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
409 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 
297 aa  92.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 
297 aa  92.4  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  29.71 
 
 
263 aa  91.7  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.17 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  31.36 
 
 
318 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0898  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0905953  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.06 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  32.37 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
275 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
295 aa  89  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 
324 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  31.12 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  31.92 
 
 
320 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  30.21 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  31.2 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  30.77 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.54 
 
 
409 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  30.86 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 
230 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 
230 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 
298 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
295 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.58 
 
 
263 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
326 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  29.83 
 
 
223 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  29.63 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  29.22 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>