More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2322 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  63.57 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  61.9 
 
 		 299 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  63.45 
 
 		 296 aa  354  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  60.96 
 
 		 303 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  52.76 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  51.03 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  55.52 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  50.84 
 
 		 296 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  53.45 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  52.41 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  53.1 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  50.85 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  50.85 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  50.51 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  48.39 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  52.76 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  49.65 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  47.74 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  46.5 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  47.13 
 
 		 326 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  47.13 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  47.93 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  48.69 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  46.5 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  48.45 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  49.01 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  47.59 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  48.37 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  47.37 
 
 		 331 aa  278  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  45.33 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  47.85 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  45.89 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  52.4 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  45.07 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  44.21 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  43.66 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  42.56 
 
 		 293 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  39.2 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 		 145 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  38.75 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50.74 
 
 		 136 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  55.96 
 
 		 116 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 		 227 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  35.17 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 		 276 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  31.58 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  31.17 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  31.17 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.06 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  31.06 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  31.58 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 232 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  36.04 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 407 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.2 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.2 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.2 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  30.68 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 230 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 		 261 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  34.4 
 
 		 264 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 235 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.88 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.9 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 230 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 		 230 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  29.84 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>