More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4121 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
235 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  89.36 
 
 
235 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  77.02 
 
 
236 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  76.07 
 
 
237 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  76.5 
 
 
237 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  76.07 
 
 
238 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  76.07 
 
 
238 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  75.74 
 
 
237 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  76.07 
 
 
238 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  74.89 
 
 
237 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  77.63 
 
 
230 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  76.07 
 
 
238 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  75.21 
 
 
237 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  74.79 
 
 
237 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  74.79 
 
 
237 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  63.91 
 
 
234 aa  321  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  58.15 
 
 
227 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  47.83 
 
 
224 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  47.39 
 
 
224 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  46.09 
 
 
224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  46.32 
 
 
228 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  44.78 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  45.69 
 
 
246 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  40.85 
 
 
227 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 
227 aa  149  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  38.86 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  37.76 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 
291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  37.78 
 
 
240 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 
296 aa  118  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  36.55 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  36.48 
 
 
295 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  35.19 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
307 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.47 
 
 
295 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.47 
 
 
295 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  33.05 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.91 
 
 
295 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
290 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.58 
 
 
254 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  36.1 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.44 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  34.19 
 
 
293 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
296 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 
299 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 
214 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 
407 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
295 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 
295 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  34.47 
 
 
297 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  34.47 
 
 
297 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
407 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 
295 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
295 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
303 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
296 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  34.17 
 
 
295 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  35.19 
 
 
295 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.3 
 
 
292 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
229 aa  98.2  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
229 aa  98.2  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  28.62 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.68 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  31.89 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
409 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
295 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  30.28 
 
 
320 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  27.44 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.71 
 
 
275 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  34.26 
 
 
295 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  31.4 
 
 
410 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 
230 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.04 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  31.33 
 
 
305 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  33.78 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  31.68 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  34.85 
 
 
233 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 
229 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  29.61 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  29.61 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 
409 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 
326 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  32.1 
 
 
413 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>