More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4562 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 297 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  80.76 
 
 		 295 aa  501  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  79.11 
 
 		 295 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  79.04 
 
 		 295 aa  491  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  71.82 
 
 		 298 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  55.82 
 
 		 295 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  54.79 
 
 		 295 aa  347  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  54.79 
 
 		 295 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  53.95 
 
 		 296 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  56.85 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  54.3 
 
 		 295 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  54.45 
 
 		 295 aa  343  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  56.51 
 
 		 295 aa  341  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  53.61 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  54.64 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  56.85 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  51.39 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  55.71 
 
 		 296 aa  315  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  54.11 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  56.3 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  50.65 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  49.52 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  48.08 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  49.52 
 
 		 320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  50.33 
 
 		 326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  50.33 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  49.19 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  50.33 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  48.29 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  49.84 
 
 		 320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  48.87 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  50.35 
 
 		 305 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  49.15 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  50 
 
 		 305 aa  298  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  47.97 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  49.15 
 
 		 291 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  46.42 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  44.79 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  48.45 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  41.16 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  61.76 
 
 		 136 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  42.62 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  36.86 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  46.32 
 
 		 145 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  32.09 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  52.68 
 
 		 116 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  38.78 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  39.6 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  38.05 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  30.1 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  35.41 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  36.1 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  34.74 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  30.69 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  30.69 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.3 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  34.91 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  30.61 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  30.27 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  36 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  30.27 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 		 409 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.51 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.64 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  31.64 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  32.69 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 415 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 		 409 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.61 
 
 		 251 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.76 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.57 
 
 		 275 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>