More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3245 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  97.59 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  94.16 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  94.16 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  94.16 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  93.81 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  92.1 
 
 		 291 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 339 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 339 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 		 290 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  76.56 
 
 		 256 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  65.52 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  66.21 
 
 		 290 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  63.45 
 
 		 290 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  62.98 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  60.69 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  61.03 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  60.34 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  59.79 
 
 		 291 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  58.28 
 
 		 290 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  58.05 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  58.27 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  56.34 
 
 		 295 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  56.32 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  55.52 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  55.02 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  53.12 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  52.58 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  53.12 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  52.78 
 
 		 291 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  51.37 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  52.22 
 
 		 299 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  53.4 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  53.4 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  52.47 
 
 		 275 aa  284  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  52.45 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  53.26 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  52.31 
 
 		 300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  51.71 
 
 		 275 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  52.09 
 
 		 268 aa  281  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  50.9 
 
 		 307 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  51.89 
 
 		 275 aa  278  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  52.29 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  52.29 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  52.29 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  52.29 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  51.15 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  51.15 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  51.33 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  51.53 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  51.33 
 
 		 267 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  51.33 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  51.52 
 
 		 275 aa  275  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  51.15 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  51.26 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  51.26 
 
 		 290 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  51.15 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  52.63 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  46.91 
 
 		 277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  50 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  47.23 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  44.96 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  41.87 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  33.73 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  35.8 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.67 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.98 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  34.44 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.56 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  33.04 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  35.85 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  35.85 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  35.85 
 
 		 322 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.28 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.89 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.28 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.51 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  29.61 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>