More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2724 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
299 aa  613  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  79.32 
 
 
296 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  73.81 
 
 
303 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  64.29 
 
 
296 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  55.14 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  54.76 
 
 
295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
295 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  49.66 
 
 
295 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  54.42 
 
 
295 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  51.39 
 
 
297 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  53.4 
 
 
295 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  53.4 
 
 
295 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  55.78 
 
 
295 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  52.72 
 
 
295 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  53.4 
 
 
295 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  51.36 
 
 
295 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  47.8 
 
 
295 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  55.1 
 
 
295 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  61.9 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  47.77 
 
 
298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  54.08 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  48.64 
 
 
294 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  46.44 
 
 
296 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  47.78 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  52.96 
 
 
254 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  49.66 
 
 
307 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  47.8 
 
 
305 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  45.16 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  49.12 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  43.91 
 
 
331 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  45.1 
 
 
320 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  44.05 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  44.05 
 
 
326 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  49.12 
 
 
291 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  45.13 
 
 
320 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  43.41 
 
 
326 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  43.09 
 
 
326 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  44.16 
 
 
320 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  46.67 
 
 
295 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  44.48 
 
 
293 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  54.81 
 
 
136 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  38.82 
 
 
324 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  52.52 
 
 
145 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  38.93 
 
 
313 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.3 
 
 
227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  51.75 
 
 
116 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  34.78 
 
 
230 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 
230 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 
230 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  35.34 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  39.44 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  40.85 
 
 
224 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  36.93 
 
 
228 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 
236 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  39.15 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  36.14 
 
 
222 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  35 
 
 
250 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
227 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 
230 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  36.14 
 
 
264 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  40.3 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.71 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  34.89 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32 
 
 
271 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  31.37 
 
 
273 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  34.78 
 
 
232 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  36.41 
 
 
305 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 
271 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 
235 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  37 
 
 
231 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  36.61 
 
 
230 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 
227 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 
271 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 
234 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  31.56 
 
 
271 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  31.11 
 
 
269 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  31.11 
 
 
271 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 
230 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.27 
 
 
261 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
420 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.11 
 
 
267 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  33.56 
 
 
322 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  31.11 
 
 
269 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  33.77 
 
 
410 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
275 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  35.09 
 
 
235 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  33.22 
 
 
303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  31.63 
 
 
290 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  33.22 
 
 
303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  37.26 
 
 
224 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>