More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3771 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 291 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  97.59 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  93.81 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  93.47 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  93.47 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  93.47 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  91.07 
 
 		 291 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 		 291 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 		 291 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 		 291 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 		 291 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 		 339 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  80.07 
 
 		 339 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 		 290 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  77.73 
 
 		 256 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  66.55 
 
 		 290 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  64.48 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  62.98 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  60.34 
 
 		 292 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  60 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  60.34 
 
 		 291 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  59.45 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  58.28 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  57.38 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  57.55 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  55.99 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  54.67 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  54.87 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  54.8 
 
 		 280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  52.92 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  52.78 
 
 		 291 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  53.47 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  53.12 
 
 		 291 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  51.03 
 
 		 291 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  52.56 
 
 		 299 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  52.72 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  52.72 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  52.47 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  53.05 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  51.33 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  51.7 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  51.71 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  52.17 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  50.9 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  51.52 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  50.76 
 
 		 271 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  50.76 
 
 		 271 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  51.53 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  51.53 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  51.14 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  51.53 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  51.53 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  50.95 
 
 		 269 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  50.95 
 
 		 267 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  51.15 
 
 		 271 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  50.95 
 
 		 269 aa  275  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  50.76 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  50.9 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  50.9 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  50.9 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  50.76 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  52.28 
 
 		 291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  49.62 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  45.82 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  46.86 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  45.32 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  42.21 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  32.94 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  34.7 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.64 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.6 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.29 
 
 		 251 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  29.1 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  34.06 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  29.48 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  30.84 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.98 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.92 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  32.41 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.9 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>