More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4421 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
290 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  82.01 
 
 
290 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  80.62 
 
 
294 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  66.09 
 
 
290 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 
291 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 
291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 
291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 
291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  65.52 
 
 
339 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 
339 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  63.79 
 
 
291 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  64.48 
 
 
291 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  63.79 
 
 
291 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  63.79 
 
 
291 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  63.1 
 
 
291 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  63.45 
 
 
291 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  61.38 
 
 
293 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  62.41 
 
 
291 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  58.76 
 
 
291 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  62.07 
 
 
291 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 
292 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 
292 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  59.93 
 
 
302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  64.71 
 
 
256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  60.95 
 
 
295 aa  353  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  58.48 
 
 
290 aa  352  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  55.86 
 
 
291 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  56.45 
 
 
291 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  55.63 
 
 
297 aa  329  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  55.63 
 
 
297 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  56.1 
 
 
291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  56.93 
 
 
299 aa  328  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  55.75 
 
 
291 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  53.47 
 
 
291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  55.07 
 
 
275 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  57.3 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  54.91 
 
 
278 aa  318  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  56.27 
 
 
307 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  55.72 
 
 
271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  55.72 
 
 
271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  55.72 
 
 
269 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  55.72 
 
 
269 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  55.72 
 
 
271 aa  310  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  52.58 
 
 
291 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  55.35 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  55.56 
 
 
267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  54.91 
 
 
275 aa  309  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  54.18 
 
 
275 aa  309  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  55.72 
 
 
291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  55.72 
 
 
291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  55.72 
 
 
291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  55.72 
 
 
291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  55.51 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  54.98 
 
 
271 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  57.41 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  55.13 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  53.73 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  54.24 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  54.32 
 
 
300 aa  298  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  53.33 
 
 
290 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
290 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  53.33 
 
 
290 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  49.82 
 
 
291 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  45.05 
 
 
277 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  45.96 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  44.95 
 
 
287 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  46.64 
 
 
270 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 
261 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 
251 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.65 
 
 
246 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
324 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  34.57 
 
 
246 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  38.56 
 
 
238 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
248 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
247 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 
247 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  33.73 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  35.54 
 
 
227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  29.78 
 
 
261 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.93 
 
 
229 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 
245 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  32.82 
 
 
295 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 
246 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  33.48 
 
 
242 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
242 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
229 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 
295 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  36.2 
 
 
303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  36.2 
 
 
303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.99 
 
 
257 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
250 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
322 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>