More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0241 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  85.53 
 
 
229 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  74.56 
 
 
229 aa  354  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  69.33 
 
 
229 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  69.33 
 
 
229 aa  332  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  67.98 
 
 
227 aa  327  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  67.11 
 
 
229 aa  318  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  65.65 
 
 
230 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  63.04 
 
 
230 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
222 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  50.22 
 
 
223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  48.03 
 
 
220 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  43.42 
 
 
229 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  42.92 
 
 
221 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  43.23 
 
 
230 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  43.64 
 
 
230 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  43.64 
 
 
230 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  43.22 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  42.98 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  42.37 
 
 
230 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  41.7 
 
 
230 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  41.86 
 
 
232 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  41.86 
 
 
232 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  42.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  39.91 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  40.74 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
232 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  42.49 
 
 
226 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  39.67 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  38.79 
 
 
252 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  39.66 
 
 
236 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  38.68 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
407 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  41.03 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  37.86 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
407 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  37.34 
 
 
251 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  40.43 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  37.71 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  38.46 
 
 
408 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  36.25 
 
 
410 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  37.39 
 
 
413 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  37.08 
 
 
248 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  36.48 
 
 
231 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  36.96 
 
 
413 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  37 
 
 
227 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  41.21 
 
 
191 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  39.09 
 
 
232 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  37.45 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  37.45 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  37.61 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  37.45 
 
 
269 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  38.2 
 
 
291 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
271 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  37.18 
 
 
271 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  38.2 
 
 
291 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  38.2 
 
 
291 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
278 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  38.2 
 
 
291 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
411 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
415 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
420 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  38.94 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  35.98 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  34.62 
 
 
409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
268 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  38.72 
 
 
302 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  37.18 
 
 
271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
415 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  36.05 
 
 
409 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  36.6 
 
 
232 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
275 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  36.05 
 
 
409 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
248 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  35.54 
 
 
299 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  35.86 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  40.22 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 
300 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  37.6 
 
 
307 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  36.68 
 
 
236 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  36.1 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
433 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
415 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  36.93 
 
 
290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
415 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>