More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6786 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  94.83 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  80.62 
 
 		 290 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  69.55 
 
 		 290 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  68.28 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  67.93 
 
 		 291 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  68.28 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  68.28 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  68.28 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  68.28 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  65.52 
 
 		 291 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  64.83 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  64.83 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  65.52 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  64.83 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  65.17 
 
 		 291 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  62.89 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  60.69 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  59.93 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  60.69 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  66.67 
 
 		 256 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  61.38 
 
 		 291 aa  358  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  58.25 
 
 		 302 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  60.73 
 
 		 295 aa  348  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  57.24 
 
 		 290 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  55.9 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  57.64 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  56.7 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  57.48 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  57.48 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  56.6 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  56.31 
 
 		 299 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  56.25 
 
 		 291 aa  328  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  56.7 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  54.45 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  54.35 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  53.87 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  56.47 
 
 		 300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  53.07 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  52.69 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  55.27 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  56.27 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  56.27 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  55.3 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  55.89 
 
 		 271 aa  298  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  55.51 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  54.89 
 
 		 269 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  55.3 
 
 		 267 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  54.51 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  55.13 
 
 		 271 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  54.17 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  51.81 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  54.37 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  55.13 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  55.13 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  55.13 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  55.13 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  52.36 
 
 		 275 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  54.75 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  51.76 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  51.76 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  51.76 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  51.59 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  49.1 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  44.16 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  47.04 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  47.96 
 
 		 270 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  38.56 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.01 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  37.17 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.37 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.72 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.72 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.22 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.46 
 
 		 214 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  29.86 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  31.6 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  32.68 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.1 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.24 
 
 		 223 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  28.15 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  32.89 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>