More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1865 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.85 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.13 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  38.96 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  38.96 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  38.96 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  37.21 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  37.78 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.28 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  36.13 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  36.13 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.17 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  36.13 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  37.34 
 
 		 268 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  37.17 
 
 		 300 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  34.15 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  35.39 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  35.39 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  35.39 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  31.34 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  35.39 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  35.39 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  36.91 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  38.33 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  34.85 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  36.8 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  35 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  34.85 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  34.85 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  34.85 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  34.22 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  37.12 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  37.12 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  35.65 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 		 291 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  32.75 
 
 		 291 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 		 291 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  36.92 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  35.16 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  32.46 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  35.43 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  34.06 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 		 291 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  32.26 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  31.28 
 
 		 291 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  31 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  28.92 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  28.92 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  28.92 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 299 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  30.33 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  32.47 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 295 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  32.47 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  35.75 
 
 		 296 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  30.7 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  32.47 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  31.7 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>