More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0536 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  64.41 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  45.45 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  40.79 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  42.98 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  39.3 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  41.13 
 
 		 275 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  40.17 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  40.17 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  40.17 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  40.17 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  39.74 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  39.74 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  38.98 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  38.98 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  38.98 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  39.74 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  39.66 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  36.55 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  39.32 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  39.32 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  39.51 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  37.08 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  39.44 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  38.93 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  37.45 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  37.04 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  36.82 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  37.66 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  35.25 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  36.57 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  35.25 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 		 291 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  38.27 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  36.59 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0147  dienelactone hydrolase  41.82 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  35.42 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 290 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  35.8 
 
 		 291 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  39.6 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  35.39 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  35.55 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  35.55 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  34.98 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  37.08 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  36.67 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  35.06 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01840  dienelactone hydrolase-like enzyme  38.64 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.470749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  37.33 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.08 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.8 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  31.38 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  35.44 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  34.55 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.38 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  32.39 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  36.92 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  34.17 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  36.92 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.94 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  27.21 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  35.15 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  33.93 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  34.93 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>