More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4876 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  65.9 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  56.58 
 
 		 272 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  40.79 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  44.44 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  43.48 
 
 		 238 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  35.41 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  34.8 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  37.91 
 
 		 300 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  34.3 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  32.28 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  32.52 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  32.52 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.38 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.64 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  33.92 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  33.92 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.38 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  33.92 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  33.92 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.64 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0147  dienelactone hydrolase  35.95 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.64 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  32.13 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32.38 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  31.56 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01840  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.56 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.470749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  31.69 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  33.49 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  33.49 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  37.85 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  33.96 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  32.73 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  31.82 
 
 		 293 aa  95.9  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 291 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  30.86 
 
 		 307 aa  95.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  34.27 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  33.79 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.4 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.8 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  33.03 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  35.37 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  29.87 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.9 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  30.21 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  33.03 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  30.33 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  32.43 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  32.43 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.15 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  32.55 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  32.43 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  30.37 
 
 		 290 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  31.48 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  31.38 
 
 		 413 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.71 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  26.39 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 		 407 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  29.3 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.36 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  31.12 
 
 		 413 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  34.56 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>