218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01840  dienelactone hydrolase-like enzyme  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.470749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0147  dienelactone hydrolase  56.39 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  39.09 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  35.24 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  39.44 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 		 254 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  35.07 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  38.53 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  30.66 
 
 		 271 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  31.1 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 291 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 291 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.1 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 291 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 291 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.55 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  32.08 
 
 		 280 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  31.1 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  30.19 
 
 		 270 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  30.66 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  30.19 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 		 268 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 		 275 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  30.19 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  33.65 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  29.36 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.63 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  28.45 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.24 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  30.94 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  30.66 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  27.68 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  29.52 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  32.23 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  25.97 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  27.49 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  29.2 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.91 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  26.2 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  29.11 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  31.96 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  24.42 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  29.58 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  35.37 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  24.42 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  28.17 
 
 		 291 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 292 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  30.37 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  26.23 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  28.17 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  28.17 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  29.72 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  30.05 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.89 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  26.64 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  23.99 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  30.29 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>