More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1727 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  57.58 
 
 
250 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  51.01 
 
 
246 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  39.32 
 
 
261 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 
251 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  33.74 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
291 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30.24 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
291 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  30.24 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 
297 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 
297 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 
290 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  29.67 
 
 
298 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  30.61 
 
 
270 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
290 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 
290 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  30.16 
 
 
290 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 
407 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  30.16 
 
 
290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 
248 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  30.16 
 
 
290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.2 
 
 
291 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  31.05 
 
 
294 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 
407 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.88 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  31.45 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  31.45 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  30.68 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.45 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  31.45 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 
291 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.35 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  31.02 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  29.27 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  30.37 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  31.37 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  31.37 
 
 
292 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  29.48 
 
 
293 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  32.27 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 
291 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  31.02 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.57 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  31.8 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  34.1 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  30.56 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
264 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
291 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  30.65 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  31.88 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  31.65 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  35.11 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  31.65 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 
302 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 
291 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
339 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  31.22 
 
 
228 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
256 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
291 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 
275 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
291 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
291 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  30.24 
 
 
299 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.07 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  28.98 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  31.5 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.14 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.1 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  34.01 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  25.9 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>