More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2198 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  81.36 
 
 		 237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  43.78 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  47.11 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  51.09 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  41.18 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  41.38 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  41.38 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  40.95 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  37 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.86 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  30.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.96 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.79 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.79 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  31.5 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  30.8 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.72 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  37.41 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  24.45 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  33.66 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  37.32 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  30.73 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  31.46 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.46 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  26.39 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  26.39 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  26.39 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  26 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  26.39 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  24.81 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  26.95 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  36.05 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  36.05 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  34.05 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.33 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.2 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  31.77 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  28.74 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  28.74 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  28.12 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  29.61 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  26.75 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.64 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  24.63 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  29.9 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  28.27 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  26.24 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  34.69 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  24.21 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  26.54 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  24.11 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  27.45 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  26.16 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  29.74 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  26.21 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25.3 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  24.26 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  25.28 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  24.68 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  28.29 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  24.91 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  24.26 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  24.68 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>