More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4008 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  77.96 
 
 
245 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  75 
 
 
246 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  75 
 
 
246 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  75 
 
 
246 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  63.11 
 
 
245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  46.41 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  37.24 
 
 
295 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  36.03 
 
 
260 aa  148  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  35.22 
 
 
246 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  36.17 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  34.17 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  35.8 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  35.83 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  33.74 
 
 
257 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
246 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.71 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  27.2 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  24.58 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 
415 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.42 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  24.17 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  25.61 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  27.87 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  29.74 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  28.46 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  25.4 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  31.7 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  31.7 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  27.08 
 
 
275 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  30.86 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  29.31 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.02 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  30.57 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  26.99 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.11 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  24.14 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  23.05 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.19 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  25.86 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  26.99 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  26.99 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  29.03 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  26.55 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  26.79 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  26.55 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  26.99 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  25.24 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  33.56 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  26.99 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  29.29 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  29.29 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  26.11 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  26.91 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  24.78 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  24.66 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  24.77 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  30.05 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  26.78 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25.41 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  29.33 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  28.38 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.61 
 
 
410 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>