251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1365 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  47.06 
 
 
287 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  44.89 
 
 
288 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  38.49 
 
 
246 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  38.49 
 
 
246 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  38.49 
 
 
246 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  37.96 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  36.73 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  35.59 
 
 
245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  37.4 
 
 
248 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  35.22 
 
 
249 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  34.41 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
260 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
246 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  31.02 
 
 
246 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 
246 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 
407 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.61 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  26.98 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  26.82 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.02 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  27.94 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 
409 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
409 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  28.28 
 
 
410 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.9 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.79 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  28.86 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  28.86 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.91 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  24.4 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  27.94 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.84 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  24.19 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.69 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.84 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.92 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  24.45 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  31.23 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  30.17 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 
227 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25.56 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25.56 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 
234 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.15 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  27.08 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 
411 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.08 
 
 
230 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.08 
 
 
230 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  27.98 
 
 
229 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  27.89 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  27.35 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  28.37 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  27.08 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  27.76 
 
 
413 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  24.69 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  25.74 
 
 
234 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  24.69 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
230 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
246 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  27.71 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  25.32 
 
 
420 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.4 
 
 
236 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  23.41 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  31.18 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  27.13 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  23.77 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  27.82 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  26.2 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  24.56 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  27.04 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  27.46 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  27.61 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  26.45 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
230 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 
236 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  27.04 
 
 
320 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.73 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  27.82 
 
 
245 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  26.12 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 
232 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>