241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2806 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  100 
 
 
287 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  47.06 
 
 
295 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  46.99 
 
 
288 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 
246 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 
246 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 
246 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  37.29 
 
 
245 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  35.83 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 
248 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  34.42 
 
 
245 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 
244 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
246 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
249 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  31.71 
 
 
246 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 
260 aa  85.5  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
407 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
407 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1497  dienelactone hydrolase  24.88 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.184657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  29.75 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
239 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  27.6 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2526  dienelactone hydrolase  23.77 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.37 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  26.85 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.8 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  26.02 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  26.17 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  23.81 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 
409 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
227 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 
420 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  22.94 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16031  dienelactone hydrolase  24.3 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.98 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  26.44 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  28.08 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  25.76 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  25.76 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  26.54 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  22.31 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.42 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  24.06 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  27.09 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  25.87 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  26.94 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  22.22 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  27.19 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
224 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  25.4 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 
415 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 
415 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  23 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  25.32 
 
 
410 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.33 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  30.21 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  23 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  23.68 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  25.52 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  25.64 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  25.64 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
415 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
224 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  25.34 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  23.79 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  23.64 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  21.82 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  27.96 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  23.79 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.55 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  25.64 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10371  dienelactone hydrolase  22.71 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>