More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4533 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  49.8 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  37.25 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  36.25 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  36.03 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 		 288 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  38.24 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  33.6 
 
 		 246 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.02 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.63 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.06 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.66 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.66 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.66 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.23 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.23 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.98 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.66 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.4 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  27.06 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  26.72 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  26.12 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  27.42 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.38 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.36 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  26.12 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  28.68 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  26.42 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  27.75 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  22.89 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.3 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  28.82 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  27.08 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  24.89 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.32 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  28.88 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  24.46 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  26.78 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.42 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  24.58 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  25.61 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  27.13 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  28.29 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  26.42 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  30.52 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  28.29 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  28.14 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.7 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  30.12 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>