More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3874 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  85.47 
 
 		 246 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  39.3 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  36.78 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  36.78 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  36.78 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  35.29 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 		 287 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  27.13 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  28.34 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  28.34 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 291 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.13 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.12 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  26.02 
 
 		 277 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.81 
 
 		 290 aa  88.6  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 280 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 		 415 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.62 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.62 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.4 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.2 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.17 
 
 		 409 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.62 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  27.09 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 		 275 aa  85.1  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.2 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.2 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  25.62 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  27.88 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  24.49 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.44 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  27.76 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  30.59 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.36 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.94 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  31.19 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  30.73 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  32.57 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.29 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  25.83 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  26.23 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  26.19 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  26.19 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.19 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.19 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  25.82 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  25.82 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  27.06 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>