More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12778 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  64.34 
 
 		 246 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  64.34 
 
 		 246 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  64.34 
 
 		 246 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  294  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  59.43 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  47.26 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  39.5 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  38.75 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  35.74 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  39.08 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  36.25 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  39.3 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  37.29 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  36.89 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.69 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  25.83 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  27.92 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  25.9 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.09 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  29.39 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  23.87 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.19 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  32.33 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  24.58 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  30.62 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  24.89 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  31.28 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  31.72 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  30.84 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  30.84 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  31.46 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  26.34 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  26.34 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  28.12 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  31.14 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  27.68 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  31.8 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  32.89 
 
 		 409 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  26.94 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.59 
 
 		 409 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  33.54 
 
 		 409 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  26.78 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  28.07 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  29.52 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  27.24 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  27.64 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  29.84 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  28.57 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  27.63 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  27.08 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  25.89 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  27.63 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  28.21 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  29.27 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  24.88 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  27.71 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  27.71 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>