More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4214 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  91.7 
 
 
262 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  66.93 
 
 
261 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  69.23 
 
 
263 aa  357  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  65.78 
 
 
263 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  63.74 
 
 
262 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  63.74 
 
 
262 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  65.78 
 
 
265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  65.4 
 
 
263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  64.12 
 
 
263 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  52.23 
 
 
269 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  48.46 
 
 
263 aa  258  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  50.2 
 
 
270 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  51.03 
 
 
263 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  52.28 
 
 
318 aa  245  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  47.77 
 
 
263 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  45.67 
 
 
267 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  44.96 
 
 
268 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  45.95 
 
 
262 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  43.58 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  46.69 
 
 
259 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  40.98 
 
 
250 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  41.77 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  37.21 
 
 
261 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.38 
 
 
264 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  41.67 
 
 
280 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  40.61 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  43.15 
 
 
273 aa  188  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  40.08 
 
 
245 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  40.5 
 
 
245 aa  185  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  42.15 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  40 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  40.91 
 
 
246 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  41.84 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  37.7 
 
 
258 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  38.1 
 
 
238 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  37.86 
 
 
237 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  37.66 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  36.97 
 
 
237 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  36.97 
 
 
238 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  36.55 
 
 
238 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  40.91 
 
 
234 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  37.72 
 
 
264 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  34.48 
 
 
261 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  38.11 
 
 
356 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  40.52 
 
 
237 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37.89 
 
 
241 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  38.59 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  38.17 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  32.83 
 
 
257 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
242 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  40.52 
 
 
234 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  33.49 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  33.61 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  33.95 
 
 
241 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  33.95 
 
 
241 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  35.22 
 
 
237 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  37.07 
 
 
234 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  33.49 
 
 
241 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  36.63 
 
 
249 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  36.21 
 
 
241 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  33.92 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  37.83 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  35.27 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  36.52 
 
 
244 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 
267 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  34.63 
 
 
265 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  33.77 
 
 
241 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  37.09 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  31.22 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  36.32 
 
 
269 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  34.17 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  33.6 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  33.5 
 
 
265 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  33.5 
 
 
265 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  33.5 
 
 
265 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 
292 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.84 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  30.06 
 
 
214 aa  85.5  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  30.96 
 
 
242 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  32.65 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  33.19 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  29.72 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  33 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  26.94 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.95 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>