More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5204 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  45.16 
 
 
249 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  148  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 
244 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 
260 aa  141  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  36.99 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  35.56 
 
 
246 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
288 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  34.82 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  34.22 
 
 
245 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  34.41 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
287 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.67 
 
 
251 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  29.73 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  28.51 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  22.53 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  24.19 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.69 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  28.92 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  27.82 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  22.98 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  27.62 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  24.39 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  22.13 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.42 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  29.67 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.76 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  24.79 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30 
 
 
409 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  24.08 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  25.64 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  35.44 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  28.86 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 
291 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.81 
 
 
409 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  26.21 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  24.6 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.88 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.58 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  23.27 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  28.21 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  25.1 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  34.81 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  29.44 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  28.14 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.46 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  28.48 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25.4 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.09 
 
 
413 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 
411 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  29.65 
 
 
413 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  20.9 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  25.32 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  24.38 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  23.58 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>