More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5771 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  53.25 
 
 
230 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  53.25 
 
 
230 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  51.72 
 
 
232 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  52.38 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  51.98 
 
 
236 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  51.95 
 
 
230 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  51.95 
 
 
230 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  53.25 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  51.95 
 
 
230 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  48.48 
 
 
232 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  49.14 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  53.71 
 
 
230 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  53.28 
 
 
230 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  48.31 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  48.46 
 
 
410 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  50.64 
 
 
237 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  45.29 
 
 
420 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  40.79 
 
 
407 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  40.69 
 
 
407 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  44.54 
 
 
408 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
409 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  40.52 
 
 
411 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  42.41 
 
 
409 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  42.15 
 
 
415 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  42.15 
 
 
415 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  40.81 
 
 
415 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  37.93 
 
 
413 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  38.57 
 
 
415 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  37.07 
 
 
413 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
433 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  37.07 
 
 
236 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  36.07 
 
 
251 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  37.55 
 
 
231 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  38.84 
 
 
409 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  37.95 
 
 
234 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 
234 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  39.91 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  35 
 
 
248 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.97 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  37.83 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  39.91 
 
 
223 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  36.48 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 
245 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.48 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 
221 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 
236 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
227 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.91 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
220 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  36.91 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  37 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  32.57 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 
232 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  36.56 
 
 
229 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  34.45 
 
 
270 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  34.47 
 
 
229 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
297 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
297 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
234 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
232 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
295 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 
280 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 
302 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.2 
 
 
299 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.87 
 
 
241 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 
296 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 
227 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 
296 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  33.83 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 
235 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
243 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  28.63 
 
 
320 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.49 
 
 
295 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  32.42 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 
295 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>