More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4232 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 263 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  93.13 
 
 		 263 aa  493  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  95.06 
 
 		 265 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  94.68 
 
 		 263 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  72.14 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  71.76 
 
 		 262 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  72.9 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  65.78 
 
 		 262 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  62.69 
 
 		 261 aa  325  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  64.73 
 
 		 262 aa  321  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  53.44 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  52.63 
 
 		 270 aa  255  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  53.75 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  47.33 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  48.98 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  49.03 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  46.15 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  47.77 
 
 		 263 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  44.53 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  44.57 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  46.33 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  41.73 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  42.56 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  37.92 
 
 		 261 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  40.71 
 
 		 273 aa  188  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  41.83 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.54 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  38.87 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  41.39 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  39.09 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  38.62 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  39.34 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  36.84 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  39.18 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  41.62 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  37.89 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  34.29 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  35.19 
 
 		 238 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  35.19 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  38.21 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  38.27 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  38.27 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  38.43 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  36.86 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  35.09 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  34.44 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  34.02 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.7 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  36.36 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  37.45 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 		 237 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  29.73 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  36.49 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  33.74 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  39.35 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  34.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  31.58 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  33.8 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  32.72 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  36.17 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  31.64 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  36.29 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  35.24 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.46 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  35.24 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  34.25 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  30 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  30.17 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  29.73 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.93 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  30.23 
 
 		 214 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  32.09 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  33.17 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  28.32 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>