More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1626 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  78.24 
 
 
242 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  77.41 
 
 
242 aa  400  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  73.25 
 
 
241 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  73.75 
 
 
241 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  72.61 
 
 
241 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  73.03 
 
 
241 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  72.2 
 
 
241 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  72.5 
 
 
241 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  54.62 
 
 
262 aa  255  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  41.74 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  50.42 
 
 
269 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  45.38 
 
 
261 aa  201  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  45 
 
 
264 aa  194  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  44.58 
 
 
264 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  43.29 
 
 
264 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  41.28 
 
 
238 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  41.28 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  39.42 
 
 
271 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  40.34 
 
 
237 aa  174  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
263 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  37.14 
 
 
318 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  39.29 
 
 
258 aa  164  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  36.25 
 
 
263 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  41.25 
 
 
234 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  39.37 
 
 
237 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  36.4 
 
 
239 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  38.72 
 
 
246 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  38.75 
 
 
237 aa  158  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  35.56 
 
 
257 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  38.67 
 
 
262 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  36.13 
 
 
267 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  35.77 
 
 
270 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  37.04 
 
 
263 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  38.05 
 
 
241 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  36.55 
 
 
269 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  35.71 
 
 
238 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  34.87 
 
 
265 aa  148  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  35.71 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 
267 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.2 
 
 
263 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  33.74 
 
 
261 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 
250 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  34.19 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 
268 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  38.39 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  32.5 
 
 
262 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  34.55 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  38.7 
 
 
237 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 
245 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  34.15 
 
 
263 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  35.65 
 
 
263 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  36.49 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  39 
 
 
262 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  30.86 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  39 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  39.79 
 
 
234 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  33.8 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  30.45 
 
 
280 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  31.22 
 
 
246 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  35.47 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 
261 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  38.05 
 
 
234 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
245 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  33.74 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  35.27 
 
 
356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  35.68 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  30.48 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  35.68 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  31.02 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  34.31 
 
 
242 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 
254 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
296 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  31.45 
 
 
249 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  30.36 
 
 
256 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  27.87 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 
292 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  28.39 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  27.07 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  29.95 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.41 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  27.48 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.07 
 
 
275 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  27.35 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.43 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>