More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1805 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  54.58 
 
 
265 aa  271  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  55.61 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  46.64 
 
 
261 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  35.09 
 
 
263 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  35.38 
 
 
261 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  35.14 
 
 
264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 
264 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  33.58 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  32.48 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  32.48 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 
242 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
263 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  34.35 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  31.06 
 
 
241 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  30.17 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  34.16 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  33.17 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  32.42 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  31.33 
 
 
262 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  30.17 
 
 
237 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  34.01 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  33.76 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 
259 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  32.69 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  30.83 
 
 
262 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 
242 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
261 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  31.4 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  32.9 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  32.23 
 
 
318 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  30.26 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  32.19 
 
 
237 aa  118  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  31.42 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  29.84 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  29.82 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  32.6 
 
 
237 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  30.98 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  29.32 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  32.85 
 
 
280 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  29.87 
 
 
264 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  32.89 
 
 
234 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  30.25 
 
 
269 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  33.81 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  29.95 
 
 
246 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  36.49 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 
241 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  28.06 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  28.88 
 
 
243 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  29.67 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  28.88 
 
 
243 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  32.08 
 
 
237 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  34.15 
 
 
256 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  28.88 
 
 
356 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  29.49 
 
 
234 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  28.9 
 
 
262 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 
245 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  27.43 
 
 
245 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  29.12 
 
 
262 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  28.97 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  28.5 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  28.02 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  29.95 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  26.19 
 
 
296 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  26.96 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.34 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  25.51 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  30.24 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  29.31 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.43 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  27.43 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  28.83 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  30.22 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  27.44 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  27.63 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2133  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.84 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  24.46 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  23.72 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  27.95 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  23.94 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>