More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2133 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2133  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  51.81 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2526  dienelactone hydrolase  44.58 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  43.65 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  31.38 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  33.66 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.9 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  32.08 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.67 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  27.04 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  25.61 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  29.79 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  26.9 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  29.87 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  30.45 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  28.94 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  31.54 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  33.02 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  28.28 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  29.75 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  29.71 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  28.28 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  30.62 
 
 		 407 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  34.12 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  35.07 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.28 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  32.68 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.28 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 433 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  29.02 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  29.77 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  29.74 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  29.38 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  30.89 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.97 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.27 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.97 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.97 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.54 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.54 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.54 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  29.12 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  32.97 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  31.8 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16031  dienelactone hydrolase  25.35 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  23.92 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.97 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  27.27 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  28.14 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  28.22 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  28.43 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  32.43 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.69 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  28.04 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.54 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  24.52 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  32.67 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>