More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0706 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  42.29 
 
 
230 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  40.36 
 
 
222 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  40.18 
 
 
223 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  38.6 
 
 
223 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  40.79 
 
 
229 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  42.49 
 
 
229 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  43.33 
 
 
227 aa  138  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  38.91 
 
 
227 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  36.49 
 
 
229 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  37.22 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  41.13 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  39.3 
 
 
229 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 
230 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  37.83 
 
 
229 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  37.83 
 
 
229 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  37.62 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  37.73 
 
 
229 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 
407 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  34.72 
 
 
191 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  33.03 
 
 
407 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  29.76 
 
 
234 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
420 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  35 
 
 
236 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27.96 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  29.21 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.91 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.44 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 
433 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  34.7 
 
 
231 aa  92  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 
415 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  29.77 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 
415 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  31.63 
 
 
408 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 
415 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
230 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 
415 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  31.05 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  35.18 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.19 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 
291 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 
244 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 
292 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 
299 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  31.39 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  29.77 
 
 
232 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 
409 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 
292 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  35.03 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.41 
 
 
410 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 
268 aa  82  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  31.48 
 
 
290 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.51 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.51 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  27.91 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  27.91 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.19 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  29.29 
 
 
271 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 
294 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  27.49 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  30.87 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  33 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  29.29 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  29.88 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  29.65 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 
291 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  29.29 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  30.56 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  30.52 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>