More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1793 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
411 aa  848    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  72.32 
 
 
409 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  71.22 
 
 
409 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  71.46 
 
 
415 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  71.57 
 
 
433 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  70.72 
 
 
409 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  70.22 
 
 
415 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  68.98 
 
 
420 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  70.72 
 
 
415 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  70.72 
 
 
415 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  64.76 
 
 
410 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  65.42 
 
 
413 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  65.17 
 
 
413 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  61.44 
 
 
407 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  60.95 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  57.57 
 
 
408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  74.12 
 
 
181 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  57.33 
 
 
236 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  46.61 
 
 
412 aa  219  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  48.47 
 
 
231 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  58.08 
 
 
193 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  47.56 
 
 
235 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  42.5 
 
 
250 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  45.73 
 
 
236 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 
232 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  46.08 
 
 
230 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  54.55 
 
 
178 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  45.16 
 
 
230 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  42.98 
 
 
236 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  44.91 
 
 
499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  53.25 
 
 
179 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  44.24 
 
 
230 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  44.78 
 
 
232 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  45.16 
 
 
230 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  45.16 
 
 
230 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  41.38 
 
 
232 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  45.16 
 
 
230 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  41.77 
 
 
237 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
232 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  47.21 
 
 
233 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  44.7 
 
 
230 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 
232 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  43.86 
 
 
230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  39.29 
 
 
232 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  37.78 
 
 
236 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  42.54 
 
 
230 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  40.52 
 
 
248 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 
235 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  35.96 
 
 
234 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  43.07 
 
 
234 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  39.15 
 
 
430 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  38.67 
 
 
222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  37.95 
 
 
240 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  40.2 
 
 
234 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
232 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  38.1 
 
 
229 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  37.73 
 
 
229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  38.58 
 
 
248 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  42.21 
 
 
230 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.33 
 
 
223 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  35.21 
 
 
221 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  37.1 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.62 
 
 
247 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  34.2 
 
 
251 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
251 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
223 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  39.58 
 
 
245 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.21 
 
 
248 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  35.56 
 
 
230 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 
229 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 
229 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  35.24 
 
 
229 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.63 
 
 
246 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 
227 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 
252 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  35.43 
 
 
223 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 
230 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
243 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  34.81 
 
 
244 aa  90.1  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  34.48 
 
 
242 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  34.48 
 
 
242 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  35.61 
 
 
191 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
296 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  31.09 
 
 
291 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  29.96 
 
 
241 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
296 aa  86.3  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  31.51 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  34.43 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>