More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5577 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  76.5 
 
 
236 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  54.7 
 
 
232 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  53.62 
 
 
236 aa  256  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  53.28 
 
 
232 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  54.7 
 
 
232 aa  254  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  55.17 
 
 
230 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  54.31 
 
 
230 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  53.88 
 
 
230 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  54.31 
 
 
230 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  54.31 
 
 
230 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  54.31 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  54.74 
 
 
230 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  56.28 
 
 
230 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  54.98 
 
 
230 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  50.64 
 
 
248 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  42.86 
 
 
410 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  44.09 
 
 
420 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  43.81 
 
 
407 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  42.04 
 
 
407 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  41.77 
 
 
411 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  43.72 
 
 
408 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  45.62 
 
 
415 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  44.93 
 
 
415 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  47 
 
 
409 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  46.54 
 
 
409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  41.92 
 
 
433 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  45.37 
 
 
415 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  45.37 
 
 
415 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  41.44 
 
 
409 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  39.73 
 
 
236 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  46.05 
 
 
222 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  39.21 
 
 
413 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  47.22 
 
 
229 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  39.01 
 
 
413 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  40.27 
 
 
232 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
229 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  41.59 
 
 
227 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  37.77 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 
247 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 
234 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  39.74 
 
 
233 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  34.57 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  37.12 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  40.87 
 
 
229 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  42.25 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  40.52 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  43.29 
 
 
229 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  42.93 
 
 
229 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  42.93 
 
 
229 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  37.44 
 
 
220 aa  131  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  38.5 
 
 
221 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  37 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 
251 aa  128  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  43.3 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  40.69 
 
 
223 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 
234 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
246 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  37.02 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  34.93 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  36.16 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  34.39 
 
 
236 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  35.32 
 
 
248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
248 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  38.43 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  41.29 
 
 
191 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  36.17 
 
 
223 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.34 
 
 
251 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
295 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 
227 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 
275 aa  98.6  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 
297 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.44 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 
296 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.02 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  30.34 
 
 
290 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  28.44 
 
 
305 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  28.7 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 
295 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 
290 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 
295 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  29.91 
 
 
290 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 
290 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 
303 aa  91.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  31.39 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>