More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2842 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  59.73 
 
 
232 aa  278  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  58.44 
 
 
232 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  48.64 
 
 
231 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  49.5 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  44.4 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  43.36 
 
 
236 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  40.35 
 
 
250 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  39.13 
 
 
407 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  38.26 
 
 
407 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  41.05 
 
 
409 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  37.93 
 
 
420 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  39.29 
 
 
411 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  40.27 
 
 
433 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  38.63 
 
 
413 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  38.03 
 
 
413 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  40.65 
 
 
236 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  37.79 
 
 
410 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  38.77 
 
 
408 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  38.53 
 
 
415 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  38.53 
 
 
415 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 
234 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  38.53 
 
 
415 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  40.27 
 
 
237 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  37.72 
 
 
232 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 
409 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 
409 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 
230 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
232 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 
230 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 
230 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
230 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
230 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  39.82 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  38.22 
 
 
236 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  41.58 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  33.03 
 
 
236 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  38.36 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  35.35 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
230 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  36.11 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  34.38 
 
 
252 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.16 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  34.09 
 
 
227 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
234 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  32.39 
 
 
261 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 
230 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.13 
 
 
251 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 
229 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  34.29 
 
 
234 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 
248 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 
247 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30.38 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 
221 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  32.72 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  32.72 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  36.32 
 
 
291 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  35.82 
 
 
191 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.53 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  36.3 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.79 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  27.9 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.3 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.97 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
296 aa  82  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 
275 aa  82  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.18 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 
275 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
263 aa  77  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>