More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6464 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  54.74 
 
 		 236 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  38.71 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  40.51 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 		 420 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  40.18 
 
 		 250 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  37.45 
 
 		 407 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 		 407 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  36.48 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  35.96 
 
 		 411 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  33.33 
 
 		 410 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  37.09 
 
 		 408 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 433 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  36.09 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  33.95 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 415 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 415 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  33.92 
 
 		 409 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 409 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  32.3 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  32.58 
 
 		 415 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  32.58 
 
 		 415 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  32.89 
 
 		 413 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  37.22 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.82 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.07 
 
 		 295 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  30.09 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  25.52 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  27.71 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  28.88 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  30.18 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.89 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.11 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.11 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  27.65 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  27.65 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  30.42 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.02 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  29.13 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  30.96 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  24.8 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  30.96 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  25.57 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.73 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  26.41 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  27.72 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  28.96 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  28.96 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  23.91 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  27.88 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  24.44 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  30.23 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>