More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0391 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  94.4 
 
 
232 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  77.19 
 
 
232 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  75.11 
 
 
230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  74.67 
 
 
230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  74.67 
 
 
230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  74.67 
 
 
230 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  74.67 
 
 
230 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  74.24 
 
 
230 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  76.75 
 
 
230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  75.88 
 
 
230 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  73.8 
 
 
230 aa  330  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  60 
 
 
236 aa  285  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  53.04 
 
 
236 aa  258  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  54.7 
 
 
237 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  51.72 
 
 
248 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  48.25 
 
 
410 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 
420 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  42.59 
 
 
407 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  43.06 
 
 
407 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  46.96 
 
 
236 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 
411 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  44.34 
 
 
433 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  42.47 
 
 
409 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  44.8 
 
 
413 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  43.44 
 
 
413 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  41.23 
 
 
408 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  42.79 
 
 
415 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  41.41 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  41.89 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  41.89 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 
409 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 
409 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  39.19 
 
 
415 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  44.5 
 
 
222 aa  164  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  41.58 
 
 
235 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  36.49 
 
 
234 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  41.28 
 
 
233 aa  157  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  39.02 
 
 
251 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  37.76 
 
 
240 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  41.86 
 
 
229 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 
250 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  39.66 
 
 
227 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  41.86 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  41.07 
 
 
229 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  41.47 
 
 
223 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  41.45 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  41.45 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  39.6 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  44.39 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  37.85 
 
 
236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  41.01 
 
 
223 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  36.91 
 
 
232 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  39.91 
 
 
220 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  39.27 
 
 
230 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  42.79 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.71 
 
 
247 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  36.75 
 
 
234 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  37 
 
 
248 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  36.16 
 
 
232 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 
247 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.47 
 
 
251 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  36.76 
 
 
229 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  39.3 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  39.11 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  40.1 
 
 
191 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  35.62 
 
 
223 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  36.48 
 
 
296 aa  118  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  37.33 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  35.81 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  37.33 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
307 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  35.71 
 
 
252 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 
299 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  32.6 
 
 
298 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
295 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 
275 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  36 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  36.44 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  36.44 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  36 
 
 
295 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  33.63 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>