More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0111 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 232 aa  476  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  77.19 
 
 		 232 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  78.51 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  70.74 
 
 		 230 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  70.74 
 
 		 230 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  70.31 
 
 		 230 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  69 
 
 		 230 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  69.6 
 
 		 230 aa  337  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  68.12 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  68.56 
 
 		 230 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  68.72 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  69.16 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  55.79 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  51.54 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  53.28 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  48.48 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  43.17 
 
 		 410 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  41.7 
 
 		 420 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  42.45 
 
 		 407 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  41.51 
 
 		 407 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  43.17 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  41.38 
 
 		 411 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  40.64 
 
 		 433 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  41.36 
 
 		 409 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  39.82 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  41.71 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  41.47 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  38.94 
 
 		 409 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  38.5 
 
 		 409 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  40.76 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  40.76 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  40.09 
 
 		 413 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  38.53 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  37.84 
 
 		 415 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  43.98 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  39.56 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  44.5 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  37.05 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  36.71 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  42.13 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  40.74 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  41.78 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  39.19 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  35.15 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  37.72 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  40.51 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  40.51 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  37.81 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  34.18 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  34.73 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  38.97 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  34.19 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.73 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  34.93 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  37.68 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  38.71 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  40.99 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  37.09 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.3 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  37.9 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.76 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  38 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 280 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  34.88 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 		 302 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  32.05 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  33.48 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  31.62 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  30.7 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.29 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  32.17 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  32.17 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  34.74 
 
 		 297 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>