More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5380 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 420 aa  859    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  69.85 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  68.87 
 
 		 409 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  68.98 
 
 		 411 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  67.82 
 
 		 410 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  66.09 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  65.69 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  65.61 
 
 		 415 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  65.61 
 
 		 415 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  65.19 
 
 		 409 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  64.94 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  61.74 
 
 		 413 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  61.5 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  60.45 
 
 		 407 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  59.7 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  60.4 
 
 		 408 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  73.89 
 
 		 181 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  51.06 
 
 		 236 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  47.84 
 
 		 231 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  47.58 
 
 		 230 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  48.44 
 
 		 230 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 		 232 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  58.08 
 
 		 193 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  47.56 
 
 		 230 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  47.11 
 
 		 230 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  47.11 
 
 		 230 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  47.01 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 		 232 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  47.11 
 
 		 230 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  45.98 
 
 		 236 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  45.15 
 
 		 235 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 230 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  48.44 
 
 		 230 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  42.36 
 
 		 250 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  41.7 
 
 		 232 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  44.78 
 
 		 236 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  47.83 
 
 		 230 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  56.49 
 
 		 178 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  55.19 
 
 		 179 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  44.09 
 
 		 237 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  45.29 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  41.98 
 
 		 499 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  40.53 
 
 		 232 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 232 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  37.93 
 
 		 232 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 		 234 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  42.13 
 
 		 234 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  40.19 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  43.48 
 
 		 222 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  42.21 
 
 		 235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  42.21 
 
 		 234 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  42.11 
 
 		 223 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  40.43 
 
 		 223 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  35.19 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 		 240 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  35.68 
 
 		 247 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 		 229 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  34.74 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 		 232 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.37 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  38.24 
 
 		 229 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 		 221 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 		 220 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  44.81 
 
 		 230 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  35.06 
 
 		 229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  33.49 
 
 		 245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.89 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 		 229 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 		 227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  35.65 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  32.76 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  35 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.19 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.91 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 		 246 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 248 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.89 
 
 		 229 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.89 
 
 		 229 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  32.76 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  36.2 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.03 
 
 		 241 aa  107  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 		 230 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  36.95 
 
 		 191 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  31 
 
 		 226 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  29.37 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>