More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2866 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  64.1 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  44.69 
 
 
222 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  41.88 
 
 
229 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  41.23 
 
 
223 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  44.16 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  40.27 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  37.93 
 
 
227 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  41.13 
 
 
230 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  42.25 
 
 
220 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3568  putative dienelactone hydrolase  36.61 
 
 
224 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  37.29 
 
 
229 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  41.03 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
229 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
229 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2906  dienelactone hydrolase  32.74 
 
 
220 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  35.81 
 
 
229 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  39.45 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  39.29 
 
 
407 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  37.96 
 
 
227 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  38.84 
 
 
407 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 
252 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  37.62 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  35.86 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 
232 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 
232 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
420 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
230 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  34.31 
 
 
433 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 
237 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 
408 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
230 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  34.18 
 
 
409 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  31.51 
 
 
413 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
409 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
409 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.67 
 
 
413 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 
415 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 
411 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  32.65 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.49 
 
 
291 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  34.68 
 
 
410 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 
295 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
295 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
415 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
415 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  32.04 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  35.19 
 
 
415 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  32.22 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  29.79 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 
295 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  34.47 
 
 
248 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 
296 aa  89  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  33.01 
 
 
224 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 
295 aa  88.2  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 
247 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
291 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  31.05 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
246 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
247 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  32.04 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  34.39 
 
 
238 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  34.39 
 
 
238 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  31.46 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  31.28 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  31.28 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.28 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  32.08 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  34.47 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>