More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2181 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  51.16 
 
 
235 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  46.32 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  48.46 
 
 
236 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  42.36 
 
 
420 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  47.91 
 
 
233 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  42.5 
 
 
411 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  44.55 
 
 
410 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  42.04 
 
 
409 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  42.36 
 
 
415 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  42.36 
 
 
415 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  41.33 
 
 
413 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  41.48 
 
 
415 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 
433 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  40.79 
 
 
407 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  40.44 
 
 
413 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  39.91 
 
 
407 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  40.61 
 
 
409 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  40.35 
 
 
232 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 
409 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  38.86 
 
 
415 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  38.26 
 
 
232 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  40.18 
 
 
234 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 
232 aa  164  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  41.09 
 
 
235 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  36.61 
 
 
236 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 
232 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 
230 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
232 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
232 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 
230 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 
230 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  35.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  34.25 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  33.89 
 
 
236 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 
248 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  32.29 
 
 
234 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
229 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  31.34 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.54 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  30.57 
 
 
223 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.67 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.2 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 
227 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
229 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
229 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
237 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
237 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 
235 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  33.7 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  31.02 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.24 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.76 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.76 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  33.85 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.3 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  28.33 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  32.17 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  29.17 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  29.07 
 
 
298 aa  78.6  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  32.02 
 
 
229 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  33.51 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>