More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1487 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  80.61 
 
 
295 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  79.11 
 
 
297 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  77.89 
 
 
295 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  67.58 
 
 
298 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  54.92 
 
 
295 aa  355  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  56.61 
 
 
295 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  54.17 
 
 
296 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  53.9 
 
 
295 aa  346  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  53.9 
 
 
295 aa  346  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  55.93 
 
 
295 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  53.22 
 
 
295 aa  342  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  52.38 
 
 
295 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  56.95 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  52.04 
 
 
296 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
299 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  50.51 
 
 
303 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  52.04 
 
 
295 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  54.58 
 
 
296 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  49.83 
 
 
296 aa  314  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  52.54 
 
 
295 aa  311  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  48.3 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  49.35 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  49.03 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  49.67 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  48.71 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  49.67 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  48.06 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  51.01 
 
 
307 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  48.39 
 
 
326 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  54.72 
 
 
254 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  48.84 
 
 
320 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  50.35 
 
 
305 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  47.88 
 
 
331 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  50.52 
 
 
305 aa  295  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  46.42 
 
 
291 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  48.12 
 
 
291 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  45.83 
 
 
295 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  49.65 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  43.54 
 
 
293 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  56.62 
 
 
136 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  40.93 
 
 
324 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
145 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  35.95 
 
 
313 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  34.56 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  54.39 
 
 
116 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  40 
 
 
318 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  36.52 
 
 
227 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  31.86 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  31.86 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  40.1 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 
415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.62 
 
 
223 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.23 
 
 
409 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.6 
 
 
251 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 
415 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  34.23 
 
 
409 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 
415 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 
261 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 
264 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  34.2 
 
 
248 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
292 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
229 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 
229 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 
291 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.82 
 
 
223 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  29.32 
 
 
257 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
246 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 
247 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
247 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
232 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 
300 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 
263 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 
232 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 
291 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  36.82 
 
 
243 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  36.2 
 
 
293 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
290 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
275 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  34.85 
 
 
229 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 
254 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  30.23 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  30.23 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
278 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.4 
 
 
241 aa  99.4  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
290 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 
227 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 
415 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>